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ふんわり R-tips

ぜんぜんわからない、俺たちは雰囲気でRをやっている

Shinyサンプルアプリケーション「04_mpg」の説明

04_mpgは、(車で走行する場合の)ガロンとマイルの関係(MPG:mile per gallon)を箱ひげ図で表示する例です。ガロンはガソリンの単位で、マイルは距離の単位。

「04_mpg」の実行

library(shiny)
runExample("04_mpg")

f:id:phmpk:20161230154313p:plain

server.R

library(shiny)
library(datasets)

# 使用するデータセットmtcarsをmpgDataに代入
# mpgDataのam特徴量を、よりわかりやすい変数に置き換え
mpgData <- mtcars
mpgData$am <- factor(mpgData$am, labels = c("Automatic", "Manual"))

# 選択された項目に対してプロットを返すサーバー側を定義
function(input, output) {

  # formula textをreactiveな式として計算
  # formula textは、以下でoutput$captionとoutput$mpgPlotそれぞれの計算で使用される
  formulaText <- reactive({
    paste("mpg ~", input$variable)
  })

  # formula textをcaptionとして返す
  output$caption <- renderText({
    formulaText()
  })

  # formula textで指定された変数に対応するplotを返す
  # outlineの指定があれば、表示する
  output$mpgPlot <- renderPlot({
    boxplot(as.formula(formulaText()),
            data = mpgData,
            outline = input$outliers)
  })
}

Code license:MIT

  • mtcarsは以下に示す、車種ごとのデータセット
> library(datasets)
> mtcars
                     mpg cyl  disp  hp drat    wt  qsec vs am gear carb
Mazda RX4           21.0   6 160.0 110 3.90 2.620 16.46  0  1    4    4
Mazda RX4 Wag       21.0   6 160.0 110 3.90 2.875 17.02  0  1    4    4
Datsun 710          22.8   4 108.0  93 3.85 2.320 18.61  1  1    4    1
Hornet 4 Drive      21.4   6 258.0 110 3.08 3.215 19.44  1  0    3    1
Hornet Sportabout   18.7   8 360.0 175 3.15 3.440 17.02  0  0    3    2
Valiant             18.1   6 225.0 105 2.76 3.460 20.22  1  0    3    1
Duster 360          14.3   8 360.0 245 3.21 3.570 15.84  0  0    3    4
Merc 240D           24.4   4 146.7  62 3.69 3.190 20.00  1  0    4    2
Merc 230            22.8   4 140.8  95 3.92 3.150 22.90  1  0    4    2
Merc 280            19.2   6 167.6 123 3.92 3.440 18.30  1  0    4    4
Merc 280C           17.8   6 167.6 123 3.92 3.440 18.90  1  0    4    4
Merc 450SE          16.4   8 275.8 180 3.07 4.070 17.40  0  0    3    3
Merc 450SL          17.3   8 275.8 180 3.07 3.730 17.60  0  0    3    3
Merc 450SLC         15.2   8 275.8 180 3.07 3.780 18.00  0  0    3    3
Cadillac Fleetwood  10.4   8 472.0 205 2.93 5.250 17.98  0  0    3    4
Lincoln Continental 10.4   8 460.0 215 3.00 5.424 17.82  0  0    3    4
Chrysler Imperial   14.7   8 440.0 230 3.23 5.345 17.42  0  0    3    4
Fiat 128            32.4   4  78.7  66 4.08 2.200 19.47  1  1    4    1
Honda Civic         30.4   4  75.7  52 4.93 1.615 18.52  1  1    4    2
Toyota Corolla      33.9   4  71.1  65 4.22 1.835 19.90  1  1    4    1
Toyota Corona       21.5   4 120.1  97 3.70 2.465 20.01  1  0    3    1
Dodge Challenger    15.5   8 318.0 150 2.76 3.520 16.87  0  0    3    2
AMC Javelin         15.2   8 304.0 150 3.15 3.435 17.30  0  0    3    2
Camaro Z28          13.3   8 350.0 245 3.73 3.840 15.41  0  0    3    4
Pontiac Firebird    19.2   8 400.0 175 3.08 3.845 17.05  0  0    3    2
Fiat X1-9           27.3   4  79.0  66 4.08 1.935 18.90  1  1    4    1
Porsche 914-2       26.0   4 120.3  91 4.43 2.140 16.70  0  1    5    2
Lotus Europa        30.4   4  95.1 113 3.77 1.513 16.90  1  1    5    2
Ford Pantera L      15.8   8 351.0 264 4.22 3.170 14.50  0  1    5    4
Ferrari Dino        19.7   6 145.0 175 3.62 2.770 15.50  0  1    5    6
Maserati Bora       15.0   8 301.0 335 3.54 3.570 14.60  0  1    5    8
Volvo 142E          21.4   4 121.0 109 4.11 2.780 18.60  1  1    4    2
  • factor()で、mpgDataのam特徴量を”Automatic”, "Manual"の2つの文字列に置き換え

  • paste()で、"mpg ~"に指定されたinput$variableを結合

  • boxplot()で、箱ひげ図のプロットを返す。as.formulaで式を指定、dataでformulaで指定するデータを指定、outlineで外れ値を表示するかどうかを指定

ui.R

library(shiny)

# ガロン/マイルを表示するUI定義
fluidPage(
  
  # タイトル
  titlePanel("Miles Per Gallon"),
  
  # サイドバーに、mpgをプロットするための変数選択と、外れ値を指定するかどうかを
  # 指定するチェックボックスを配置
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      selectInput("variable", "Variable:",
                  c("Cylinders" = "cyl",
                    "Transmission" = "am",
                    "Gears" = "gear")),
  
      checkboxInput("outliers", "Show outliers", FALSE)
    ),
    
     # captionとplotをmainPanelに配置
    mainPanel(
      h3(textOutput("caption")),
      
      plotOutput("mpgPlot")
    )
  )
)

Code license:MIT

  • selectInput()で、Cylinders, Transmission, Gearsのいずれかの文字列を選択

  • checkboxInput()でチェックボックスを配置。チェックした場合の返り値はTRUEで、初期値はFALSE

  • h3()で、h3の大きさのcaptionを配置

  • plotOutput()でmpgPlotで指定した箱ひげ図を表示