はじめに
R Markdownを導入してレポートを作成する方法について述べます。すでに、R Markdown、pandocについて知っている人向けに、最短で環境を構築して書き始めるにはどうすればいいんだっけ？という質問への回答エントリになっています。詳しい説明は、まったくしない(できない)ので、読み進める方は注意して下さい。
インストール
Rのコンソールでinstall.packages(“rmarkdown”)を実行
pandocのインストール
インストールの確認
library(rmarkdown) pandoc_available()
インストールされていれば、rmarkdownのパッケージ呼び出しでエラーが出ず、pandoc_available()で[1] TRUEが返ってきます。
R Markdownファイル(*.Rmd)の作成
Rawファイルと変換後のhtmlファイルをGithubにアップロードしています。
上記の例では、bernoulli.Rmdとしてファイルを作成します。日本語はShift JISで保存します。UTF-8だと文字化けします。
R MarkdownからHTMLを生成
library(rmarkdonw) render("bernoulli.Rmd")
pandocを使えば、さらにPDF, MS Word, Beamer, ioslides, reveal.jsに変換することもできます。
